La Junta Ejecutiva celebra tres períodos de sesiones oficiales por año: el primer período de sesiones ordinario (EB.1) en febrero, el período de sesiones anual (EB.A) en junio y el segundo período de sesiones ordinario (EB.2) en noviembre. En circunstancias especiales, la Junta Ejecutiva también puede celebrar períodos de sesiones extraordinarios.
Además, la Secretaría de la Junta Ejecutiva organiza consultas oficiosas y sesiones de información para los miembros.
Todo Estado Miembro de las Naciones Unidas o de la FAO que no sea miembro de la Junta Ejecutiva puede participar en las deliberaciones de la Junta Ejecutiva, previa solicitud, sin tener derecho de voto. Los representantes de determinadas organizaciones también pueden participar en los períodos de sesiones, previa invitación, en calidad de observadores.