أمانة المجلس التنفيذي، التي يشرف عليها نائب المدير التنفيذي، هي صلة الوصل بين الأعضاء (أعضاء المجلس والمراقبون) وأمانة البرنامج.
ويقود أمين المجلس التنفيذي فريقاً من الموظفين الذين يتولون القيام، ضمن جملة أمور، بما يلي:
- تنظيم دورات المجلس؛
- تنسيق اجتماعات هيئة المكتب؛
- تنظيم الندوات التشاورية بشأن المسائل التي تهم المجلس وأمانة البرنامج؛
- ترجمة وثائق المجلس إلى اللغات الرسمية؛
- توفير سجلات رسمية للاجتماعات المتعلقة بالمجلس؛
- ضمان الترجمة الفورية إلى اللغات الرسمية خلال دورات المجلس والندوات التشاورية؛
- تيسير تنظيم الزيارات الميدانية لأعضاء المجلس؛
تزويد مندوبي المجلس بما يطلبونه من معلومات